6月25日，学校发布了《关于征集校庆六十周年标志的通知》，征集工作得到了广大师生、海内外校友和社会各界人士的积极响应，共收到来自全国各地的应征作品80余件。根据网上投票和专家投票的结果，学校确定了候选作品。在此基础上，学校多次邀请专家召开座谈会，进一步征求意见和建议，对候选作品进行了修改与完善，形成了上报学校的校庆标志方案。10月30日，经学校党委常委会议审议，最终确定了学校60年校庆标志。

60周年校庆标志以“60”为核心创意，辅以建校、校庆年份“1953-2013”，并融合浪花、彩虹、五星、船舵、校标等主要元素，表达了哈尔滨工程大学校庆60周年的主题和精神内涵。数字“60”鲜明体现了哈尔滨工程大学喜迎建校60华诞的主题；数字“6”似飞舞的浪花，绚烂夺目、波澜壮阔，体现了哈尔滨工程大学60年办学的光辉历程，寓意学校乘风破浪、勇往直前、不断开拓创新的精神品质；数字“0”为五星、彩虹、船舵的巧妙结合，体现了哈尔滨工程大学忠诚、坚韧的精神品质，继承发扬“哈军工”优良传统，服务国家工业化、信息化和国防现代化的坚定信念，坚持“三海一核”（船舶工业、海军装备、海洋工程、核能应用）办学方略的特色发展理念；数字“0”中间为哈尔滨工程大学校标，点明主题。

校长刘志刚为校庆标志揭幕并为获奖代表颁奖

5月30日，学校发文成立60周年校庆筹备委员会和校庆工作办公室，标志着学校60周年校庆筹备工作正式启动。28日，校党委下发《哈尔滨工程大学校庆60周年实施方案》。校庆日定为2013年9月1日。校庆活动的指导思想是：深入贯彻落实科学发展观，继承和发扬“哈军工”优良传统，以“传承、进取、超越”为主题，以“隆重、热烈、特色、俭朴”为原则，精心打造“学术校庆、文化校庆”品牌，总结过去，规划未来，进一步扩大对外影响，凝聚广大校友，激励全校师生，加快建设特色鲜明的高水平研究型大学的步伐，为实现我校建设特色鲜明的高水平研究型大学的奋斗目标奠定坚实的基础。

校庆的主要活动安排有：重要展馆、建筑物开馆、落成仪式，哈军工精神研讨会，建校60周年庆典大会，中外大学校长论坛，建校60周年庆典文艺晚会。2013年5月至9月期间，学校还将开展系列师生和校友庆祝活动，包括学术交流、报告会、研讨会、成果展、文体活动等。